Daten gehen verloren beim Download von CSV-Dateien

Hallo PHP Profis !

da ich nicht mehr weiter weiss, habe ich mir gedacht, ich frage mal die PHP profis, die haben bestimmt Ahnung.

Also ich habe folgendes Problem.
Ich lade mir täglich von ungefähr 6 verschiedenen Servern Daten herunter. Das habe ich mit einem Cronjob eingerichtet. Immer im Abstand von einer Stunde, lasse ich ein PHP-Script laufen, die mir dann die Daten herunterlädt und in die Datenbank speichert. Die Daten werden berechnet und in der Datenbank angezeigt.
Nur komischerweise verlier ich ab und zu Daten, d.h. wenn die CSV-Datei 1000 Zeilen hat dann habe ich 950 Zeilen. Also habe ich 50 Zeilen verloren. Oder aber ich habe 1050 Zeilen, also mehr als wie überhaupt drin ist. Das ist aber nicht jeden Tag so sondern nur ab und zu.
Also meine Frage, woran kann das liegen? An meinem Script? Oder an dem Cronjob?
Ich stelle hier die Frage, weil vielleicht jemand auch schon dasselbe Problem hatte.

Schon im Voraus Vielen Dank
Gruß omc